В ходе проверки выяснилось, что университет получил 16 миллионов рублей от Минобрнауки России для премирования профессорско-преподавательского состава, однако ректор, по версии правоохранительных органов, распорядился о собственной премии свыше 3,5 миллионов рублей. Следствие также проверяет информацию о том, что затем эти деньги были возвращены в кассу вуза за счет средств, собранных с проректоров.
В ходе проведенной проверки установлено, что в 2010 году ВУЗ получил от Министерства образования и науки России 16 миллионов рублей. Эти средства предназначались для премирования профессорского-преподавательского состава.Как полагают в правоохранительных органах, ректор университета издал и подписал приказ, согласно которому определил размер собственной премии свыше 3,5 миллионов рублей. Однако, согласно действующему законодательству, подобное материальное поощрение руководителя образовательного учреждения относится к компетенции Министерства образования и науки и выходит за пределы его должностных полномочий. Кроме того, в настоящее время проверяется информация о том, что возращенная впоследствии в кассу университета сумма была собрана с проректоров ВУЗа.